El Tren maya tendrá un impacto negativo en los servicios ambientales que nos brindan los ecosistemas que serán afectados, en las áreas más importantes de recarga del manto freático:
i) el anillo de cenotes denominado Reserva Geohidrogeológica y
ii) las selvas de la región de Calakmul, donde las aguas cosechadas son transportadas y acumuladas para fluir hacia los principales sistemas costeros de la península de Yucatán y alimentar 6 de las 9 subcuencas hidrográfica.
También será afectada la capacidad de estos ecosistemas forestales de capturar a través de la fotosíntesis, el bióxido de carbono atmosférico, es decir, de ser sumideros de carbono
Aquí el resumen del análisis de riesgos hecho por investigadores del CONACYT
http://geopolitica.iiec.unam.mx/sites/default/files/2020-03/RESUMEN-EJECUTIVO-GCTTM-ok.pdf